第一章 御坂16842
“第9768次实验将在2分43秒后开始，请实验方一方通行做好准备。御坂再一次确认。”
现在是晚上9点27分17秒，在学园都市某一个黑暗的小巷，一个茶色短发，身穿常盘台夏季校服的少女和一个白色头发红色双瞳的少年对峙着。
“呐，真是跟你谈不上来呢。”一方通行从集装箱上跳下来，用着明显带着调侃的语气说到。
“实验将在15秒后开始，请实验方一方通行做好准备，御坂最后一次提醒。”
“实验进入倒计时10，9，8…”少女一边将头上的军用夜视仪戴在头上，一边熟练的将手中的冲锋枪打开保险，“3，2，1，实验开始！”说着迅速后退几步，将自己和一方通行的距离拉开，几发子弹从枪口射出，但子弹在落到白色少年身上之前就被不可思议的反射回来，按照原来的弹道轨迹射回枪管，穿透少女的身体，红色的黏稠液体从少女身上流出，不久后少女就渐渐失去了生机。
“呐，今天的实验结束了，回去喝咖啡去。”被称作一方通行的白发少年将双手插在裤袋里，反身走入了黑暗之中。
过了几分钟之后一群和死去的少女长得一模一样的少女们从黑暗中走出来，其中一个少女说“开始进行回收作业，10016将实验体进行回收，10017之后的个体进行处理现场，御坂开始发布任务”二十几分钟后，仿佛这里从来没有发生过任何战斗。
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某一个实验室中，一个浸泡在绿色试管中的少女渐渐睁开了眼睛。“你醒了”一个穿着白色研究服的研究员对她说，说着在某个机器上按了一下，女孩所处试管中的液体缓缓下降，试管的玻璃门也开了一个角落，少女打开玻璃门走了出来，双眼无神的看着研究员。研究员看着什么也没有穿的少女，指着一套常盘台夏季校服对她说“先把这个穿上吧”。
少女走到校服面前，将校服穿了起来。这时，研究员对她说“汇报你的编号。”“体检编号16842，御坂诚实的回答”“刚做完身体调整，你的身体应该没什么大碍了，你先去熟悉一下环境吧”少女点了点头，向着实验室大门走去。
量产能力者计划，就是利用素体御坂美琴的DNA图谱，大量生产能力者，也就是克隆，但是能力确是素体的百分之一，素体御坂美琴的能力等级是level5，那么克隆体的能力就是level2。而绝对能力者进化计划，则是建立在量产能力者计划之上的，内容就是将拥有安全进入level6的能力的学园都市NO.1一方通行进化成level6，根据树状图设计者的演算，如果正常的提升，那么就需要250年的时间，而用128种不同的战场击杀128名“超电磁炮”也能进化，但是由于不可能有复数的“超电磁炮”，所以才将目光看向了量产能力者计划，树状图设计者通过演算，得出了这样的结论:只要准备20000种不同的战场和20000名“妹妹”，则能达到同样的效果，于是就有了绝对能力者进化计划。
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